La Jonquera to hiszpański klub piłkarski z siedzibą w La Jonquera, w prowincji Girona w Katalonii. Został założony w 1944 roku i obecnie gra w Tercera División RFEF - Grup 5.

Stadion domowy klubu to Estadi Municipal La Jonquera, który został otwarty w 1979 roku i może pomieścić 1000 osób.

Największym osiągnięciem La Jonquera był awans do Segunda División B w sezonie 1997-98, gdzie spędzili dwa sezony. Klub grał także w Copa del Rey w kilku okazjach, docierając do trzeciej rundy w sezonie 2014-15.