Whittlesea United został założony w 1968 roku i obecnie gra w Narodowej Premier League Victoria 2. Klub odniósł sukcesy w lidze stanowej, zdobywając mistrzostwo w 1976, 1994 i 2006 roku.

Whittlesea United gra na stadionie Epping Stadium, który jest jego siedzibą od 1984 roku.

Najbardziej znanym zawodnikiem klubu jest Mark Viduka, który grał w Whittlesea United w latach 1990-1993, zanim przeniósł się do Melbourne Knights. Viduka reprezentował Australię na dwóch mundialach, w 2006 i 2010 roku.